Ильдар Фуатович более 20 лет руководит кафедрой травматологии, ортопедии и хирургии экстремальных состояний Казанского государственного медицинского университета. Основные научные исследования Ильдара Фуатовича в последние годы посвящены разработке и усовершенствованию методов лечения патологии крупных суставов у детей и взрослых, травматологии пожилого возраста.
Им опубликовано более 400 научных публикаций, в том числе 11 монографий, 30 учебных пособий и методических рекомендаций. Он является автором 116 авторских свидетельств, патентов РФ на изобретения и полезные модели. Под руководством Ахтямова И.Ф. подготовлены и защищены 20 диссертационных исследований.
В 1996 году Ильдару Фуатовичу присвоено почетное звание «Заслуженный изобретатель РТ», а в 2008 – «Заслуженный врач РТ». Он Лауреат Государственной премии по науке и технике РТ, Лауреат премии Фонда им. академика Г.А. Илизарова.
Ахтямов И.Ф. – член экспертного совета по травматологии и ортопедии, а также по ревматологии Минздрава РФ, научно-методической комиссии при «Всероссийском учебно-научно-методическом центре по непрерывному медицинскому и фармацевтическому образованию» МЗ РФ, член редакционных советов семи медицинских журналов, двух Диссертационных советов, член АТОР и Всемирной организации ортопедов-травматологов SICOT.
В марте 2012 года Ильдар Фуатович избран действительным членом (академиком) Академии медико-технических наук Российской Федерации.
За вклад в развитие травматологии и ортопедии Российской Федерации в 2013 году профессор Ахтямов награжден золотой медалью им. Н.Н. Приорова – высшей профессиональной наградой по специальности «травматология и ортопедия» Российской Федерации. В 2013 году награжден медалью «За заслуги в развитии здравоохранения Республики Казахстан».